Maria sötétkék ruhában ül, vagy térdel, majdnem a csoport közepén. Állandóan és halkan bámul a kolduló Jánosra, jobb kezével a vállait ölelve, míg bal kezét védekező módon Jézus fölé emeli. Angyal figyelmesen nézi a képet egy csendes mosollyal, kapcsolatba lépve a nézővel. Jobb kezével, mivel az angyal János őre, az angyal rá mutat, baljával pedig támaszkodik a Jézus csecsemőre, aki Jánosra néz, és felemeli az egyik kezét. Így a csoportot szem és gesztus kapcsolja össze a nézővel. Úgy tűnik, hogy az előtérben lévő sziklás, kő láb hirtelen esik. Ez azonnal világossá teszi, hogy a hely távoli és elszigetelődik, és ezt a körülvevő vad sziklák hangsúlyozzák.
A sziklák között több helyen a vízben és a hegyekben is látható a köd. A háttér ragyogása, a víz és a növények pislogása enyhíti a sziklák szellemetlen légkörét. Ez a hatás a fényben folytatódik. Ezen elemek némelyike vallásos szimbólumokként értelmezhető: a víz, valamint a gyöngyök és a kristályok, amelyeket Mária ruháinak rögzítésére használják, tisztaságának szimbólumaiként is elfogadhatók. A sziklalakzatok úgy olvashatók, mint Mária szimbólumai: az Isten Anyja tiszta képe olyan, mint egy szikla, nem válhat emberi kéz által létrehozott hasadékká vagy természeti erők által elpusztíthatatlan kőtömbökké. Ezenkívül egy szikla, a sziklák közötti barlang menedéket jelent a csecsemő számára. János és Krisztus. 1483-ban Milánóba érkezve Leonardo megrendelést kapott a Testvériségtől a Szent Francisco templomban. A Testvériség felhatalmazta Leonardo-t, két helyi művésztel, a Predis testvérekkel együtt,
A szerződés részletes utasításokat tartalmazott a művészeknek a nagy oltár-mélyedés festésével és aranyozásával kapcsolatban, amelyet az ács már 1482-ben elkészített. Leonardo egy központi csoportot írt, amely két változatban maradt fenn. A kettő közül a legrégebbi a párizsi Louvre-ban található, míg a második verzió a londoni Nemzeti Galériában található. Az oldalak két játszó angyallal, Leonardo kollégájának, Ambrogio de Predisnek festett festményeivel, ugyanabban a galériában vannak Londonban. A festmény a nagy oltár-mélyedés központi csoportja. Jobbról és balról angyalok nagy alakjai vannak. A díszítést a Mária életét ábrázoló jelenetek fejezik be, a fenti pedig a próféták és az Atya Isten szobrai. A szünet közepén lévő fülkeben található a Madonna és Gyermek szobor.
Leonardo festményét ezután a rés elõtt a sínekre helyezték el, és az év 364 napján elrejtették Madonna és Gyermek szobroit. Csak december 8-án, ünnepnap alatt, Leonardo festménye mechanikusan elmozdult. Leonardo egy Sziklás-barlangban ábrázolta a Szűz Márist, a babát, a Szent Jánosot és egy angyalt – tehát a név, amellyel a mai képet tudjuk, igaz. 199×122.1483-86 1483. április 25-én a Szeplőtelen Fogantatás helyi testvériségének tagjai felkérték a művészt, hogy festessen képet a kápolna oltárához. Nyilvánvaló, hogy ez volt Leonardo első festői rendelése Milánóban. Sforza hercege, akinek a szolgálatába Firenze lépett be, először tehetségét főleg palotafesztiválok szervezésére használta.
Leonardo mindazonáltal ezt nem örömmel tette – lehetősége van a képzeletre és a képességére, hogy műszaki terveit elvégezze. A festés Leonardo számára szintén kísérleti terület volt. A Testvériség parancsát teljesítve az általa kitalált sfumato technikát alkalmazta, amely a továbbiakban a festészet egyik jellemzőjévé vált. A vászonján lévő tárgyaknak nincs egyértelmű határok: minden, ahogy a természetben is homályos, áthatol egymásba, azaz lélegzik, él, felébreszti a képzeletét. Az olasz azt tanácsolta a hallgatóknak, hogy gyakorolják az ilyen diszpergálást a falak nedves foltokra, hamura, felhőkre vagy szennyeződésre nézésével. Egy köd borítja Mary alakjait, két csecsemőt – Jézust és Jánosot – és egy angyalt. Angyal arca sem férfi, sem nő.
A művész egy nem szexuális lény arcát festette, amelynek nyilvánvalóan az angyaloknak kell lennie. A Mary mögött megnyíló táj fantasztikusnak tűnik. De maga Leonardo azt állította, hogy a festészet tudomány. Amint az akkori rajzokból kitűnik, geológiai jelenségek és növények kutatásával foglalkozott. Tudását továbbadta a képhez. Megadhatja az itt ábrázolt növények típusát. Leonardo még a nap után is képes volt fordulni. Van egy másik festmény, a Madonna in the Rocks, később írt.
Úgy gondolják, hogy megjelenése ezzel összefügg. Leonardo nagyon rosszul végezte pénzügyeit. Gyakran túllépte a megrendelést, amelyért a munka során kapott pénzéből nagy összegű haszonbüntetést kellett fizetnie. De mindig gyorsabban költöztette őket, mint amennyit elkészített a képpel, és nem tudott bírságot fizetni. Ennek eredményeként hosszú panaszok és perek követték őt. De szerencséje volt: mindig megjelenik egy jótevő, általában a következő mecénása, aki kifizette adósságait. Tehát ez történt ezúttal. A mecénás XII. Lajos francia király volt. Leonardo hálásan bemutatta neki a Madonna első változatát a Sziklákban. És a kápolna számára ő vagy tanulói készítettek egy példányt.