A Giotto által készített freskó kompozíciós vázlata a bizánci prototípus egyedi vonásait teljesen új motívumokkal ötvözi, amelyek fokozzák az események hitelességének hatását, ami annyira fontos a művész számára.
A bizánci művészethez hasonlóan Krisztust az asztal szélére helyezik, és szeretett János feje a mellén nyugszik. Az apostolok alakjait az asztal mindkét oldalára helyezik, így a kompozíció kompaktabbá és kiegyensúlyozottabbá válik, ritmikus mintája pedig bonyolult.
De a legfontosabb dolog az, hogy ennek köszönhetően a művésznek lehetősége van nemcsak a szimbolikus, hanem az érzelmi kapcsolat felvázolására is az utolsó vacsora összes résztvevője között. Most beszélhetnek, megjegyzéseket cserélhetnek és megbeszélhetik a mi történik.
A Giotto másik jelentős újítása a cselekvési térbeli környezet meghatározása a kis, aszketikusan berendezett szoba belsejének prospektív módon értelmezett képe miatt.